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5、可配由亚型数据库和特征峰检测算法组成的亚型分析模块，能够在菌株水平鉴别耐药菌株和区分质谱图非常相近的菌株。具体功能包括：(1) 脆弱拟杆菌 (Bacteroides fragilis) 分型，检测对碳青酶烯类抗菌药物的耐药；(2) 金黄色葡萄球菌 (Staphylococcus aureus) 分型，检测MRSA（耐甲氧西林金黄色葡萄球菌）；(3) 通过分型区分高度亲缘的Listeria李斯特菌种，确认单核细胞增生李斯特菌 (Listeria monocytogenes)；(4) 区分嵌合体分枝杆菌和胞内分枝杆菌 (Mycobacterium chimaera/intracellular)。

6、配备 β-内酰胺酶活性检测模块,通过测定β-内酰胺类抗生素经β-内酰胺酶水解的代谢产物，判断菌株的耐药性。可对氨苄西林、哌拉西林、头孢噻肟、厄他培南等抗生素进行检测。